Kirkon rakentamista edelsi riita kirkon paikasta pitäjän ylä- ja alapääläisten kesken. Alapääläiset halusivat kirkon rakennettavaksi nykyisen Könnintien varteen noin kilometrin päähän keskustasta, yläpääläiset taas ehdottivat nykyistä paikkaa. Asia ei pystytty pitäjässä ratkaisemaan kaikkia tyydyttävällä tavalla. Riita vietiin tuomiokapituliin ja lääninhallitukseen. Maaherran kantana oli nykyinen paikka. Riita jatkui, mutta ratkaisuun löytyi luonnollinen syy. Keväällä 1763 nousi tulva korkealle ja peitti alleen alapääläisten kirkon paikan. Myös osa rakennuspaikalle tuoduista rakennushirsistä meni tulvaveden mukana. Asia oli ratkennut ja Ilmajoen kolmannen kirkon rakentaminen sai alkaa.

> Ilmola saa oman kappelikirkkonsa